Nhiệm kỳ 2012-2017, các tổ chức Đoàn thuộc Trường Quân sự Quân khu 3 đã tổ chức nhiều hoạt động bổ trợ, phát động nhiều phong trào thi đua có ý nghĩa, thiết thực, góp phần củng cố, nâng cao nhận thức và khơi dậy tinh thần xung kích, sáng tạo của ĐVTN.
5 năm qua, tuổi trẻ nhà trường đã đóng góp 122 đề tài, sáng kiến, chuyên đề khoa học có giá trị, trong đó có 36 đề tài tham gia thi cấp bộ và đoạt giải; tu sửa trên 1.000 mô hình học cụ, bia, bảng vật chất các loại.
Hàng năm, Đoàn cơ sở nhà trường phối hợp với Bệnh viện T.Ư Quân đội 108 tổ chức cho hơn 2.000 lượt cán bộ, chiến sĩ tham gia hiến máu tình nguyện.
Bỏ phiếu bầu đại biểu đi dự Đại hội đại biểu Đoàn TNCS Hồ Chí Minh Quân khu 3 lần thứ IX
Nhiệm kỳ 2017-2022, Đoàn cơ sở nhà trường xác định phấn đấu xung kích thực hiện và hoàn thành 100% nội dung, chương trình giáo dục - đào tạo, kiểm tra 100% đạt yêu cầu, có trên 85% đạt khá, giỏi, thi tốt nghiệp có trên 100% hoàn thành nhiệm vụ, có 80% trở lên khá giỏi; tuyên truyền, vận động 100% cán bộ Đoàn, ĐVTN tham gia phong trào “Tuổi trẻ sáng tạo”, phấn đấu mỗi năm mỗi cấp Đoàn cơ sở có 2-3 sáng kiến có giá trị, được cấp trên công nhận.
Đại hội đã tiến hành bầu 18 đại biểu chính thức đi dự Đại hội đại biểu Đoàn TNCS Hồ Chí Minh Quân khu 3 lần thứ IX với số phiếu tín nhiệm cao.